- Docente: Matteo Masetti
- Crediti formativi: 4
- SSD: CHIM/08
- Lingua di insegnamento: Italiano
- Modalità didattica: Convenzionale - Lezioni in presenza
- Campus: Bologna
- Corso: Laurea Magistrale a Ciclo Unico in Chimica e tecnologia farmaceutiche (cod. 8412)
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dal 17/04/2023 al 31/05/2023
Conoscenze e abilità da conseguire
Al termine del corso lo studente possiede le conoscenze di base sugli approcci e metodologie computazionali consolidati ed emergenti in ambito chimico farmaceutico. Lo studente è in grado di affrontare le diverse problematiche che caratterizzano le fasi di scoperta e sviluppo di un farmaco attraverso la scelta delle metodiche computazionali più opportune.
Contenuti
- Introduzione al corso. Distinzione tra metodi computazionali di tipo simulativo e di Machine Learning.
- Metodi simulativi: concetto di superficie di energia potenziale e metodo della dinamica molecolare.
- Cenni di meccanica statistica nella descrizione del processo di legame proteina-ligando.
- Applicazione di metodi simulativi:
- Predizione dell’energia libera di legame proteina-ligando
- Predizione della cinetica di legame proteina-ligando
- Studio di meccanismi allosterici e di trasduzione del segnale
- Come bersagliare “target difficili” (proteine intrinsecamente disordinate, cavità criptiche, …)
- Cenni di modellistica multiscala.
- Metodi di Machine Learning: classi di metodi di apprendimento automatico (supervised e unsupervised).
- Tipologia di dati in chimica farmaceutica e concetto di featurization.
- Applicazione di metodi di Machine Learning:
- Predizione di proprietà molecolari
- De novo design
- Riposizionamento di farmaci
- Predizione di reattività e analisi retrosintetica
- Cenni all’integrazione di metodi simulativi e di machine learning.
Testi/Bibliografia
Articoli scientifici e review indicate dal docente.
Metodi didattici
Lezioni frontali accompagnate da “case studies” con lo scopo di mostrare l'applicazione pratica, nel mondo reale della ricerca e dell'industria, delle metodologie descritte.
Modalità di verifica e valutazione dell'apprendimento
La prova di verifica dell'apprendimento è costituita da colloqui orali sugli argomenti trattati durante il corso.
Strumenti a supporto della didattica
Slides, pubblicazioni scientifiche ed altro materiale di insegnamento reso disponibile attraverso la piattaforma Virtual Learning Environment.
Orario di ricevimento
Consulta il sito web di Matteo Masetti