- Docente: Rita Casadio
- Crediti formativi: 10
- SSD: BIO/10
- Lingua di insegnamento: Inglese
- Modalità didattica: Convenzionale - Lezioni in presenza
- Campus: Bologna
- Corso: Laurea Magistrale in Bioinformatics (cod. 8020)
Conoscenze e abilità da conseguire
At the end of the course, the student has the basic knowledge for developing and using tools for sequence and structure analysis of biomolecules and more generally for annotation problems in the genomic era. In particular, the student will be able to: discuss the theoretical basics of some machine learning tools (Neural Networks, Hidden Markov Models); selecting programs for problem solving; writing programs.
Contenuti
- Algorithms for sequence motif search
- Pairwise sequence alignment Algorithms:
- global
- semiglobal
- local - Use of existent implementations, such as: align, lalign..
- Multiple sequence alignments:
- basics
- progressive
- Sequence-Profile and Profile-Profile alignments
Testi/Bibliografia
online
Metodi didattici
Lezioni, esercitazioni
Modalità di verifica e valutazione dell'apprendimento
Test finale
Strumenti a supporto della didattica
PC, Internet
Orario di ricevimento
Consulta il sito web di Rita Casadio