93312 - MODELS OF BIOLOGICAL NETWORKS

Conoscenze e abilità da conseguire

Al termine del corso, lo studente possiede conoscenze sulle reti di interazioni tra molecole biologiche (proteine, acidi nucleici, metaboliti) e sugli approcci sperimentali per la loro determinazione su larga scala. Lo studente possiede le competenze per l’interrogazione delle banche dati e per l'utilizzo di strumenti di analisi dedicati a dati di interazione. Inoltre acquisisce conoscenze sui metodi computazionali per la modellazione e l'analisi della complessità delle reti di interazione nel contesto delle funzioni cellulari. Lo studente è in grado di applicare criticamente conoscenze e competenze in contesti pratici, tra cui la caratterizzazione funzionale di geni e insiemi di geni e l'interpretazione dell'effetto delle variazioni genetiche sulle funzionalità della rete molecolare.

Contenuti

• Metodi sperimentali per la determinazione delle interazioni proteina-proteina
• Metodi sperimentali per la determinazione delle interazioni tra proteine e acidi nucleici
• Metodi di inferenza per le interazioni proteina-proteina
• Database di interazioni proteina-proteina, di pathway metabolici e di vie di segnalazione
• Tipi di interazioni proteina-proteina
• Domini strutturali conservati che mediano le interazioni proteina-proteina o proteina-acidi nucleici
• Analisi strutturale di tali domini tramite software di grafica molecolare

Testi/Bibliografia

Articoli e review saranno forniti durante le lezioni, forniti in formato PDF, non divulgabili, e saranno disponibili per gli studenti sulla piattaforma IOL (https://iol.unibo.it/)

 

Metodi didattici

Lezioni supportate da diapositive

Esercitazioni con software di grafica molecolare

Modalità di verifica e valutazione dell'apprendimento

La verifica dell'apprendimento si svolgerà tramite modalità orale. Una prima valutazione verrà svolta sulla base di seminari individuali che si terranno durante il corso. La valutazione finale prevederà un colloquio (esame) durante il quale sarà verificato l'apprendimento del programma di studio. Gli studenti sono tenuti a comunicare via email la loro intenzione di accettare il voto di MODELS OF BIOLOGICAL NETWORKS. Se accettato, il voto di MODELS OF BIOLOGICAL NETWORKS sarà considerato valido per un anno solare e verrà mediato con il voto di MOLECULAR SIGNALLING TRASDUCTION. La prof.ssa Porcelli verbalizzerà il voto finale.

Orario di ricevimento

Consulta il sito web di Luisa Iommarini