85305 - MULTISCALE MODELING

Anno Accademico 2024/2025

  • Docente: Matteo Masetti
  • Crediti formativi: 6
  • SSD: CHIM/08
  • Lingua di insegnamento: Inglese
  • Moduli: Matteo Masetti (Modulo 1) Matteo Masetti (Modulo 2)
  • Modalità didattica: Convenzionale - Lezioni in presenza (Modulo 1) Convenzionale - Lezioni in presenza (Modulo 2)
  • Campus: Bologna
  • Corso: Laurea in Genomics (cod. 9211)

Conoscenze e abilità da conseguire

Al termine del corso, lo studente conosce le basi teoriche e gli strumenti computazionali per affrontare problemi che mostrano caratteristiche critiche su scala multipla temporale o spaziale. Durante la parte pratica lo studente impara ad utilizzare le simulazioni al computer per risolvere semplici problemi di modellizazione e delle dinamiche molecolari.

Contenuti

  • Introduzione ai modelli computazionali e ai metodi simulativi
  • Il concetto di equilibrio in meccanica e in termodinamica
  • Funzioni di energia potenziale e potenziale termodinamico
  • Il ruolo dell'entropia nei processi molecolari
  • La distribuzione di Boltzmann
  • Modelli a reticolo
  • Modelli a due stati
  • Modelli al continuo
  • Modelli atomistici
  • Simulazioni di Dinamica Molecolare
  • Modelli "coarse-grained"
  • Elementi di modellazione multiscala
  • Discussione di casi di studio dalla letteratura scientifica

Testi/Bibliografia

Materiale di studio fornito dal docente durante le lezioni.

Rob Phillips, Jane Kondev, Julie Theriot, Hernan Garcia. Physical Biology of the Cell, 2nd edition, 2013, Garland Science, Taylor & Francis Group.

Metodi didattici

Lezioni frontali e laboratori pratici al computer assistiti da tutor didattici.

In considerazione della tipologia di attività e dei metodi didattici adottati, la frequenza di questa attività formativa richiede la preventiva partecipazione di tutti gli studenti ai Moduli 1 e 2 di formazione sulla sicurezza nei luoghi di studio in modalità e-learning.

Modalità di verifica e valutazione dell'apprendimento

La preparazione degli studenti verrà valutata in base a:

  • risultato di compiti assegnati durante i laboratori pratici
  • domande inerenti l'intero contenuto del corso (lezioni frontali e laboratorio)

Strumenti a supporto della didattica

Slides elettroniche, pubblicazioni scientifiche ed altro materiale di insegnamento reso disponibile attraverso la piattaforma Virtual Learning Environment.

Orario di ricevimento

Consulta il sito web di Matteo Masetti