96261 - STRUCTURAL BASES OF MOLECULAR INTERACTIONS

Conoscenze e abilità da conseguire

Al termine del corso, lo studente possiede conoscenze sulle reti di interazioni tra molecole biologiche (proteine, acidi nucleici, metaboliti) e sugli approcci sperimentali per la loro determinazione su larga scala. Lo studente possiede le competenze per l’interrogazione delle banche dati e per l'utilizzo di strumenti di analisi dedicati a dati di interazione. Inoltre acquisisce conoscenze sui metodi computazionali per la modellazione e l'analisi della complessità delle reti di interazione nel contesto delle funzioni cellulari. Lo studente è in grado di applicare criticamente conoscenze e competenze in contesti pratici, tra cui la caratterizzazione funzionale di geni e insiemi di geni e l'interpretazione dell'effetto delle variazioni genetiche sulle funzionalità della rete molecolare.

Contenuti

• Caratteristiche generali e tipi di interazioni proteina-proteina
• Metodi sperimentali per la determinazione delle interazioni proteina-proteina e proteine-acidi nucleici
• Metodi di inferenza per le interazioni proteina-proteina
• Databases di interazioni proteina-proteina, pathway metabolici e vie di segnalazione
• Domini strutturali conservati che mediano le interazioni proteina-proteina o proteina-lipidi
• Analisi strutturale di tali domini tramite software di grafica molecolare (Lab Bioinformatico)
• Analisi di reti biologiche (Lab Bioinformatico)
  

Testi/Bibliografia

Articoli e review saranno forniti durante le lezioni, forniti in formato PDF, non divulgabili, e saranno disponibili per gli studenti sulla piattaforma Virtuale (https://virtuale.unibo.it/)

Metodi didattici

Lezioni supportate da diapositive

Esercitazioni con software di grafica molecolare (Chimera) e di analisi di reti biologiche (Cytoscape). I programmi sono liberamente scaricabili e installabili su Windows, MacOS e Linux.

Modalità di verifica e valutazione dell'apprendimento

La verifica dell'apprendimento si svolgerà tramite modalità SCRITTA con domande a risposta multipla e domande aperte. Gli studenti sono tenuti a comunicare via email la loro intenzione di accettare il voto di STRUCTURAL BASES OF BIOLOGICAL NETWORKS. Se accettato, il voto di STRUCTURAL BASES OF BIOLOGICAL NETWORKS sarà considerato valido per un anno solare e verrà mediato con il voto di MOLECULAR SIGNALLING TRASDUCTION. La prof.ssa Porcelli verbalizzerà il voto finale.

Strumenti a supporto della didattica

Videoproiettore, PC, internet. Le slides delle lezioni saranno disponibili.

Orario di ricevimento

Consulta il sito web di Luisa Iommarini