- Docente: Alberto Danielli
- Crediti formativi: 6
- SSD: BIO/11
- Lingua di insegnamento: Inglese
- Moduli: Alberto Danielli (Modulo 1) Andrea Vannini (Modulo 2)
- Modalità didattica: Convenzionale - Lezioni in presenza (Modulo 1) Convenzionale - Lezioni in presenza (Modulo 2)
- Campus: Bologna
- Corso: Laurea in Genomics (cod. 9211)
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Orario delle lezioni (Modulo 1)
dal 04/03/2024 al 11/06/2024
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Orario delle lezioni (Modulo 2)
dal 12/06/2024 al 13/06/2024
Conoscenze e abilità da conseguire
Al termine del corso, lo studente conosce le macromolecole che partecipano all'organizzazione delle cellula e comprende i meccanismi fondamentali della regolazione genica, della sintesi proteica, della replicazione, della riparazione e della ricombinazione.
Contenuti
INTRODUZIONE: CELLULE E GENOMI
Le caratteristiche universali delle cellule. Gli elementi costitutivi delle cellule. Il genoma come progetto di vita. Dogma centrale della biologia molecolare. Ripiegamento delle proteine, domini, modifiche, interazioni. La membrana plasmatica. Il bilayer lipidico. Gamma di dimensioni e forme cellulari.
STRUTTURA E FUNZIONE DEGLI ACIDI NUCLEICI
Doppia elica del DNA. Variazioni topologiche del DNA, superavvolgimento. Il nucleoide batterico. Il DNA cromosomico e il suo impacchettamento nella fibra cromatinica. Struttura e versatilità dell'RNA
REPLICAZIONE CELLULARE
Il ciclo cellulare eucariotico. Cicline e cdks. Replicazione del DNA. Segregazione dei cromosomi. Il fuso mitotico.
TRASCRIZIONE
Dal DNA all'RNA. Polimerasi, promotori, terminazione. Regolazione trascrizionale
ELABORAZIONE DELL'RNA
Capping. Poliadenilazione. Maturazione dell'rRNA, Editing dell'RNA, Modifiche dell'RNA.
TRADUZIONE
Dall'RNA alle proteine: il codice genetico. Ribosomi. tRNA, AA-tRNA sintasi Il secondo codice genetico. Iniziazione, allungamento e terminazione della traduzione, segnali di arresto e fattori di rilascio, chaperoni proteici. Proteasoma
RIBORGOLAZIONE
Regolazione da parte di RNA non codificanti, sRNA batterici, riboswitch.
Laboratori per studenti
Risposte cellulari al danno al DNA
Riparazione della rottura del dsDNA e ricombinazione omologa
Trasporto di membrana intracellulare
Principi di segnalazione cellulare
Il citoscheletro
L'apoptosi
Giunzioni cellulari e ECM
LAB DIDATTICO
Studio in vivo della regolazione post-trascrizionale mediata dall'sRNA RyhB in Escherichia coli
Mutagenesi sitospecifica
Elettroforesi preparativa su gel
Purificazione del DNA
Ligazione
Clonaggio molecolare
Fusioni di geni reporter GFP
Fluorimetria
ESERCIZI DI ANALISI DI SEQUENZA
Testi/Bibliografia
Craig et al.
Molecular Biology - Principles of Genome Function - second edition
OXFORD Press
Alberts et al.
Molecular Biology of the Cell - sixth edition
Garland Science
Milo & Phillips
Cell Biology by the Numbers
freely available from http://book.bionumbers.org/
Altro materiale didattico su Virtuale UniBO. https://virtuale.unibo.itMetodi didattici
Lezioni frontali con presentazioni powerpoint riassuntive
Stime ed esercizi per allenare la numerazione biologica
Sessioni di problem solving, approcci attivi in classe
Workshop per studenti
Attività pratiche (wet-lab)
Esercizi di analisi delle sequenze
IMPORTANTE: In considerazione delle tipologie di attività e metodi didattici adottati, la frequenza di questa attività formativa richiede lo svolgimento da parte di tutti gli studenti (compresi tutti gli studenti internazionali incoming, es. ERASMUS) dei moduli 1 e 2 in modalità e-learning [https://www.unibo.it/it/servizi-e-opportunita/salute-e-assistenza/salute-e-sicurezza/sicurezza-e-salute-nei-luoghi-di-studio-e-tirocinio] e la partecipazione al modulo 3 di formazione specifica sulla sicurezza e salute nei luoghi di studio. Indicazioni su date e modalità di frequenza del modulo 3 sono consultabili nella apposita sezione del sito web di corso di studio ("studiare"--"formazione obbligatoria su sicurezza e salute").
Modalità di verifica e valutazione dell'apprendimento
Esame scritto, comprendente 5 sezioni:
Domande di base
Domande di approfondimento
Domande aperte
Strip Sequence
Domande analitiche
Valutazione del workshop
Rapporto di laboratorio
Servizio per gli Studenti con Disabilità e con DSA
Strumenti a supporto della didattica
Lavagna
Presentazioni di diapositive .pdf/.ppt
Video
Apprendimento collaborativo di gruppo
Software di editing del DNA
Attività di laboratorio molecolare
Orario di ricevimento
Consulta il sito web di Alberto Danielli
Consulta il sito web di Andrea Vannini
SDGs
L'insegnamento contribuisce al perseguimento degli Obiettivi di Sviluppo Sostenibile dell'Agenda 2030 dell'ONU.