99480 - VIRAL GENETICS AND GENOMICS

Anno Accademico 2022/2023

  • Docente: Laura Menotti
  • Crediti formativi: 6
  • SSD: BIO/19
  • Lingua di insegnamento: Inglese
  • Modalità didattica: Convenzionale - Lezioni in presenza
  • Campus: Bologna
  • Corso: Laurea in Genomics (cod. 9211)

Conoscenze e abilità da conseguire

Al termine del corso, lo studente conosce le caratteristiche dei virus e degli agenti subvirali, così come le loro peculiarità in biologia. Lo studente conosce: -le basi della biologia dei virus e le loro interazioni con le cellule ospiti - l’organizzazione dei genomi virali e le strategie replicative delle diverse tipologie di virus – le teorie sulle origini dei virus – l’evoluzione del genoma vitale – le tecnologie dell’ingegneria del genoma virale – le applicazioni dei virus modificati geneticamente – le applicazioni delle informazioni genomiche in campo epidemiologico e nella previsione e tracciamento delle epidemie.

Contenuti

PARTE 1
INTRODUZIONE

Definizione di virus, criteri di classificazione dei virus, struttura e composizione dei virus.
Le fasi del ciclo di replicazione virale.
Curva di crescita virale. Metodi di coltura e identificazione dei virus.
I diversi esiti dell'infezione virale: infezioni produttive, abortive, persistenti e latenti. Meccanismi di ingresso del virus nella cellula ospite e trasporto dei componenti subvirali nei diversi compartimenti cellulari.
GENETICA VIRALE
Le classi replicative virali I-VII (sistema di Baltimore).
Strategie di replicazione ed espressione genica in relazione all'organizzazione del genoma virale (virus a RNA con polarità positiva o negativa, genomi monopartiti o segmentati; retrovirus, hepadnavirus; virus a DNA con genoma a doppio o singolo filamento).
Strategie di economia genetica.
Agenti subvirali, definizioni e proprietà: viroidi e satelliti.


PARTE 2
EVOLUZIONE DEL GENOMA DEI VIRUS
Origine dei virus.
Origine della diversità nei genomi dei virus.
Tasso di mutazioni rispetto alla stabilità e/o alle dimensioni del genoma.
Quasispecie virali.
Paleovirologia.
Retrovirus endogeni e genomi integrati non retrovirali.
Virus emergenti.
Virus pandemici.
GENOMICA DEI VIRUS
Prospettiva macroevolutiva: comprensione della virosfera (origine del virus, evoluzione del genoma, scala temporale dell'evoluzione e interazioni virus-ospite)
Prospettiva applicata: trasmissione epidemiologica e patogenesi delle infezioni virali; gestione dei pazienti e sanità pubblica; previsione dell'emergenza dei virus.
Risorse e applicazioni per la genomica virale.
INGEGNERIA DEL GENOMA VIRALE
Tecnologie di ricombinazione, cloni di cDNA infettivi, sistema "replicon".
Applicazioni di virus geneticamente modificati (fagi, virus animali, virus vegetali).
Virus e nanotecnologie: nanoparticelle a base di virus.


PARTE 3
Attività di gruppo e seminari su letteratura aggiornata.
Lezioni seminariali su invito.

Testi/Bibliografia

Principles of Virology, 4th Edition (2015), S.Flint et al, ASM Press.

"FIELDS Virology", Sixth Edition, Lippincott Williams & Wilkins, 2013.

Online resources (NCBI, ViralZone, etc.).

Metodi didattici

Lezioni in aula con presentazioni in Powerpoint
Lezioni interattive, sondaggi
Test di autovalutazione
Attività di gruppo
Student Journal Club

Modalità di verifica e valutazione dell'apprendimento

L'esame consiste in test scritti e nella valutazione della presentazione dello Student Journal Club. Le date dei test saranno pubblicate su AlmaEsami.

Strumenti a supporto della didattica

Presentazioni in Power-point
Multimedia (filmati)
Sondaggi online

Orario di ricevimento

Consulta il sito web di Laura Menotti

SDGs

Salute e benessere Lotta contro il cambiamento climatico La vita sulla terra

L'insegnamento contribuisce al perseguimento degli Obiettivi di Sviluppo Sostenibile dell'Agenda 2030 dell'ONU.