Dottorato in Biologia Cellulare e Molecolare

Anno accademico 2021-2022
Area tematica Scienze Biologiche, Geologiche e Agrarie
Ciclo 37
Coordinatore Prof. Vincenzo Scarlato
Lingua Inglese, Italiano
Durata 3 anni
Posti 10 posti. Maggiori informazioni nella Scheda del dottorato
Scadenza bando 21/05/2021 ore 12:00 (Scaduto)
Periodo di immatricolazione Dal 16/07/2021 al 26/07/2021
Data inizio corso 01/11/2021
Sede dottorato
Bologna
Struttura proponente
Dipartimento di Farmacia e Biotecnologie - FaBiT
Periodo all'estero
3 mesi
Temi di ricerca
  • Meccanismi d'instabilità genomica nei tumori (Prof. Capranico)
  • Biotecnologia molecolare dei fagi per lo sviluppo di piattaforme vettoriali teranostiche (Prof. Danielli)
  • Genomica computazionale e funzionale (Prof. Ferrè)
  • Trascrittomica computazionale delle reti geniche umane (Dott. Giorgi)
  • Fattori genetici nella patogenesi dell'autismo (Prof.ssa Maestrini, Prof.ssa Bacchelli)
  • Studio delle basi molecolari di alcune malattie neurodegenerative (Prof.ssa Monti)
  • Regolazione dell'espressione genica nei tumori (Prof. Perini)
  • Caratterizzazione del profilo molecolare dei tumori solidi (Dr. De Biase)
  • Basi molecolari di malattie neurodegenerative a patogenesi mitocondriale e mutazioni del genoma mitocondriale nella tumorigenesi (Prof.ssa Porcelli, Prof.ssa Ghelli)
  • Basi genetiche e molecolari della patogenicità batterica (Prof. Scarlato)
  • Meccanismi molecolari di segnalazione redox e regolazione del metabolismo energetico delle piante (Prof. Trost, Prof.ssa Sparla)
  • Caratterizzazione filogenetica e funzionale di comunità microbiche umane e ambientali: studio delle interazioni fra microorganismi e habitat. (Prof.ssa Vitali)
  • Strutture, funzioni e interazioni di metallo-proteine (Dr.ssa Zambelli)
Sbocchi professionali e potenziali settori di impiego del dottorato di ricerca
Il Dottore di ricerca potrà:
- svolgere attività di ricerca e sviluppo in Enti di ricerca pubblici o privati, e incubatori biotecnologici,
- svolgere attività di coordinamento nei vari settori della ricerca biochimica e biologia cellulare,
- promuovere e sviluppare, con autonomia operativa, l'innovazione scientifica e tecnologica nel settore delle biotecnologie applicate in campo farmaceutico, diagnostico, dei biomateriali e dei vaccini, nonché della comunicazione scientifica,
- svolgere attività in laboratori che offrono servizi di diagnostica molecolare per progettazione e consulenza tecnica,
- svolgere attività in laboratori che sviluppano modelli cellulari o modelli animali per progettazione e ricerca,
- svolgere il ruolo di manager scientifico in istituzioni pubbliche/private per ottenere finanziamenti per la ricerca da organizzazioni nazionali/europee e di gestione della proprietà intellettuale nel campo biomedico,
- avviare spin-off, con applicazioni di tipo biologico/biotecnologico,
- dedicarsi ad attività di docenza in scuole di ogni ordine e grado, una volta completati gli ulteriori specifici percorsi formativi.
Commissione esaminatrice

Cognome Nome Ateneo/Ente Ruolo email
Bacchelli Elena Università di Bologna Membro effettivo
Capranico Giovanni Università di Bologna Membro effettivo
Scarlato Vincenzo Università di Bologna Membro effettivo
Sparla Francesca Università di Bologna Membro effettivo
Danielli Alberto Università di Bologna Membro supplente
Maestrini Elena Università di Bologna Membro supplente
Monti Barbara Università di Bologna Membro supplente
Porcelli Anna Maria Università di Bologna Membro supplente
Obiettivi formativi del dottorato
L'obiettivo del Dottorato è la preparazione di una figura professionale altamente qualificata e capace di condurre indagini scientifiche, di analizzare ed interpretare risultati sperimentali, di formulare e verificare ipotesi scientifiche, di comunicare i risultati ottenuti, di organizzare e programmare la ricerca sia di base che applicata in settori trainanti della Biologia moderna. Il programma consiste sia di didattica frontale che di attività di ricerca, e ha l'obiettivo di fornire allo studente ulteriori e approfondite conoscenze generali della Biologia cellulare e molecolare e, nello stesso tempo, di fornirgli un training di ricerca sperimentale in uno specifico settore. La flessibilità del programma permette l'adeguamento agli interessi specifici di ciascun candidato e la preparazione alla specializzazione in una delle molteplici area della Biologia moderna.
Tipologia dell'attività svolta dai dottorandi
Insegnamenti comuni a più dottorati del Dipartimento cui il dottorato afferisce:
- Come si scrive un articolo scientifico (12 ore). Responsabile: Prof. Alberto Danielli.
- Corso di base in Scienza degli Animali da Laboratorio (12 ore). Organizzatore: Prof.ssa Barbara Monti.
- Introduzione alla ricerca finanziata dall’Unione Europea e Protezione e Valorizzazione della Proprietà Intellettuale (6 ore). Organizzatore: ARIC - Dott. Simone Maccaferri e Dott.ssa Maria Grazia Fumo.
- "The Peer Review Process" e "10 Tips for Scholarly Publishing" (6 ore) - Organizzatore: Prof.ssa Maria Laura Bolognesi.
- English for science (20 ore). Corso offerto da CILTA, UniBO.
- Winter School in Bioinformatics. Organizzatore: prof. Pier Luigi Martelli.

Insegnamenti specifici per il dottorato:
- Workshop annuale del dottorato sulle tematiche di Ricerca in Biologia Cellulare e Molecolare (16 ore). Responsabile: Prof. V. Scarlato.
- Calorimetria e light-scattering: Teoria e applicazioni per la caratterizzazione di proteine in soluzione (14 ore). Responsabile: Dr.ssa B. Zambelli.
- Bio-cristallografia (16 ore). Responsabile: dr. Luca Mazzei.
- Corso su specifica tematica del progetto di tesi di dottorato (20 ore): Ogni docente del collegio svolgerà insegnamenti specifici sulla propria tematica di ricerca.
- Seminari o cicli di seminari del Dipartimento a cui il dottorato afferisce (30 ore/anno tenuti da docenti/esperti della materia). Organizzazione: Prof.ssa Anna Maria Porcelli e Prof. Giovanni Capranico.
- Seminari interdisciplinari dell' Istituto di Studi Avanzati dell'Università di Bologna (20 ore/anno tenuti da docenti/esperti della materia).
- Attività di tutorato negli insegnamenti di laboratorio dei corsi di Laurea e/o Laurea Magistrale affini alle tematiche di ricerca affrontate (entro un tetto massimo di ore per anno accademico).
Attività di formazione alla ricerca previste per i dottorandi in coerenza con gli obiettivi formativi del dottorato
Il programma formativo prevede sia attività comuni a tutti i dottorandi, sia attività individuali e specifiche volte all'acquisizione di capacità di pianificazione, attuazione e interpretazione critica degli esperimenti che è conseguita attraverso il lavoro sperimentale specifico del progetto di ricerca. Ampliamento e consolidamento culturale acquisito attraverso cicli seminariali, corsi specifici, partecipazioni a congressi, discussione dei risultati sperimentali sia nell'ambito del gruppo (Journal clubs e data clubs) che nell'ambito del Collegio con la partecipazione dei docenti e di tutti i dottorandi (workshops). Specificamente, i dottorandi acquisiranno nozioni sulla scienza degli animali da laboratorio e delle norme di utilizzo e manipolazione di radionuclidi e approfondiranno le basi della Calorimetria e del light-scattering. Acquisiranno abilità di tutoraggio attraverso il co-tutoraggio di studenti in tesi di Laurea Triennale e/o Magistrale e partecipazione alla scrittura di lavori scientifici e della tesi di dottorato.
Elementi di internazionalizzazione del dottorato
Ogni dottorando dovrà trascorre un periodo in una istituzione di ricerca all'estero. La capacità di attrazione del dottorato a livello internazionale è ottima, con circa l'11 % (4 su 37) di candidati stranieri negli ultimi 4 cicli, di cui 2 borse di studio Marie Curie.
Prodotti e risultati attesi dalle attività di ricerca dei dottorandi
Il dottorando dovrà essere autore di:
- pubblicazioni su riviste scientifiche a diffusione internazionale con fattore di impatto e/o pubblicazioni su riviste internazionali senza fattore di impatto e/o pubblicazioni su libri;
- relazioni del dottorando in forma orale e/o di poster a congressi internazionali o nazionali e/o di brevetti internazionali e nazionali.
Collegio dei docenti
Nome Cognome Ateneo/Ente Qualifica
Elena Bacchelli Università di Bologna Professore Associato
Giovanni Capranico Università di Bologna Professore Ordinario
Alessia Ciarrocchi Arcispedale S. Maria Nuova-Reggio Emilia Primo Ricercatore
Dario De Biase Università di Bologna Ricercatore a tempo determinato
Fabrizio Ferrè Università di Bologna Professore Associato
Anna Maria Ghelli Università di Bologna Professore Associato
Federico Manuel Giorgi Università di Bologna Ricercatore a tempo determinato
Elena Maestrini Università di Bologna Professore Associato Confermato
Barbara Monti Università di Bologna Professore Associato
Giovanni Perini Università di Bologna Professore Ordinario
Anna Maria Porcelli Università di Bologna Professore Associato
Davide Roncarati Università di Bologna Professore Associato
Vincenzo Scarlato Università di Bologna Professore Ordinario
Francesca Sparla Università di Bologna Professore Associato
Paolo Bernardo Trost Università di Bologna Professore Ordinario
Beatrice Vitali Università di Bologna Professore Associato
Barbara Zambelli Università di Bologna Ricercatore Confermato

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