Le principali tematiche di ricerca affrontate da SB riguardano lo sviluppo di pipeline bioinformatiche e l'analisi di dati omici (metabolomi, genomi, proteomi e metagenomi) in diverse specie di interesse zootecnico (suino, bovino, coniglio, oloturia, spigola, ape). L'analisi dati spazia dall'analisi del singolo dataset fino all'integrazione del dato in un contesto di Systems Biology, usufruendo inoltre di ulteriori dati e metadati disponibili nelle diverse banche pubbliche.
Coordinate dal Prof. Fontanesi, PI del Gruppo di Genomica Animale e degli Alimenti, tali attività sono portate avanti nell'ambito dei seguenti progetti:
- TREASURE (H2020) - "Diversity of local pig breeds and production systems for high quality traditional products and sustainable pork chains" (2015-2019).
- DUAL BREEDING – "Le razze bovine a duplice attitudine: un modello alternativo di Zootecnia eco-sostenibile". Fondo Europeo Agricolo per lo Sviluppo Rurale, sottomisura 10.2 del PSRN (2018-2020).
- SUIS – "Suinicoltura Italiana Sostenibile". Fondo Europeo Agricolo per lo Sviluppo Rurale, sottomisura 10.2 del PSRN (2018-2020).
- CUN-FU – "La cunicoltura del futuro: benessere e sostenibilità degli allevamenti cunicoli italiani”. Fondo Europeo Agricolo per lo Sviluppo Rurale, sottomisura 10.2 del PSRN (2018-2020).
- PigPhenomics – "Applied phenomics and genomics in pigs for the identification and use of new phenotypes in breeding plans". PRIN2017 - MIUR, Ministero dell’Istruzione, della Università e della Ricerca (2019-2022).
- BEE-RER – "L’analisi del DNA ambientale del miele e di contaminanti per la valorizzazione e la difesa delle produzioni apistiche e per il monitoraggio degli aggressori dell’alveare in Emilia-Romagna" finanziato dalla Regione Emilia-Romagna (2019-2020).
- LIVESTOCK-STOP-COVI - "Applicazioni di genomica ambientale e analitica avanzata per una strategia One Health di contrasto alla diffusione del contagio da coronavirus mediante monitoraggio negli allevamenti e sugli animali di interesso zootecnico". Finanziato al CIRI-Agroalimentare nell’ambito del PORFESR Emilia-Romagna 2014-2020 Asse 1 - Ricerca e innovazione - Azione 1.2.2: Supporto alla realizzazione di progetti complessi di attività di ricerca e sviluppo su poche aree tematiche di rilievo e all’applicazione di soluzioni tecnologiche funzionali alla realizzazione della strategia di S3. Bando per sostenere progetti di ricerca ed innovazione per lo sviluppo di soluzioni finalizzate al contrasto dell’epidemia da COVID-19 (giugno 2020 – gennaio 2021).
- VirAnimalOne - "Application of animal genomics and data mining to predict and monitor novel coronavirus potential infections". Finanziato da European Open Science Cloud (EOSC) nell’ambito della call: Fast track Process for Covid-19 Co-creation Request (giugno 2020 - marzo 2021).
- AnGen1H - Animal genomics for a “One Health” perspectives in the COVID-19 pandemic era: Free access to computational infrastructures. Finanziato da "The EGI call for COVID-19 research projects" (giugno 2020 – maggio 2021).
- eHoney - "Computational-intensive analysis of honey derived environmental DNA information to disclose the effect of climate change on biodiversity." Finanziato da EGI-ACE (EGI Advanced Computing for EOSC).
