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Pietro Di Lena

Professore associato

Dipartimento di Informatica - Scienza e Ingegneria

Settore scientifico disciplinare: INF/01 INFORMATICA

Pubblicazioni

Pietro Di Lena; Ken Nagata; Pierre Baldi, Deep architectures for Protein Contact Map Prediction, «BIOINFORMATICS», 2012, 28, pp. 2449 - 2457 [articolo]

Vassura M.; Di Lena P.; Margara L.; Mirto M.; Aloisio G.; Fariselli P.; Casadio R., Blurring contact maps of thousands of proteins: what we can learn by reconstructing 3D structure., «BIODATA MINING», 2011, 4, pp. . - . [articolo]

Di Lena P.; Fariselli P.; Margara L.; Vassura M.; Casadio R., Divide and Conquer strategies for protein structure prediction., in: Mathematical Approaches to Polymer Sequence Analysis, NEW YORK, Springer, 2011, pp. 23 - 46 [capitolo di libro]

B. Tang; P. Di Lena; L. Schaffer; S. Head; P. Baldi; E. Thomas, Genome-Wide Identification of Bcl11b Gene Targets Reveals Role in Brain-Derived Neurotrophic Factor Signaling, «PLOS ONE», 2011, 6, pp. . - . [articolo]

Di Lena P.; Fariselli P.; Margara L.; Vassura M.; Casadio R., Is There an Optimal Substitution Matrix for Contact Prediction with Correlated Mutations?, «IEEE/ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS», 2011, 8, pp. 1017 - 1028 [articolo]

Di Lena P.; Fariselli P.; Margara L.; Vassura M.; Casadio R., Fast overlapping of protein contact maps by aligment of eigenvectors, «BIOINFORMATICS», 2010, 26, pp. 2250 - 2258 [articolo]

Di Lena P; Margara L.; Vassura M.; Fariselli P.; Casadio R., A new protein representation based on fragment contacts: towards an improvement of contact maps predictions, in: Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics, Heidelberg, Springer, «LECTURE NOTES IN COMPUTER SCIENCE», 2009, pp. 210 - 221 (atti di: 5th International Meeting, CIBB 2008, Vietri sul Mare, 3-4 ottobre 2008) [Contributo in Atti di convegno]

Pietro Di Lena; Marco Vassura; Luciano Margara; Piero Fariselli; Rita Casadio, On the Reconstruction of Three-dimensional Protein Structures from Contact Maps, «ALGORITHMS», 2009, 2, pp. 76 - 92 [articolo]

A. Dennunzio; P. Di Lena; E. Formenti; L. Margara, On the directional dynamics of additive cellular automata, «THEORETICAL COMPUTER SCIENCE», 2009, 410, pp. 4823 - 4833 [articolo]

P. Di Lena; P. Fariselli; L. Margara; M. Vassura; R. Casadio, On the upper bound of the prediction accuracy of residue contacts in proteins with correlated mutations: the case study of the similarity matrices, in: Algorithms in Bioinformatics, Heidelberg, Springer, «LECTURE NOTES IN COMPUTER SCIENCE», 2009, pp. 62 - 72 (atti di: 9th International Workshop, WABI 2009, Philadelphia, 12-13 settembre 2009) [Contributo in Atti di convegno]

M. Mirto; I. Epicoco; S. Fiore; M. Cafaro; A. Negro; D. Tartarini; D. Lezzi; O. Marra; A. Turi; A. Ferramosca; V. Zara; G. Aloisio; G. Donvito; L. Carota; G. Cuscela; G. P. Maggi; G. La Rocca; M. Mazzucato; S. My; G. Selvaggi; G. Scioscia; P. Leo; L. Di Pace; G. Pappada'; V. Quinto; M. Berardi; F. Falciano; A. Emerson; E. Rossi; G. Lavorgna; A. Vanni; L. Bartoli; P. Di Lena; P. Fariselli; R. Fronza; L. Margara; L. Montanucci; P. L. Martelli; I. Rossi; M. Vassura; R. Casadio; T. Castrignanò; D. D’Elia; G. Grillo; F. Licciulli; S. Liuni; A. Gisel; M. Santamaria; S. Vicario; C. Saccone; A. Anselmo; D. Horner; F. Mignone; G. Pavesi; E. Picardi; V. Piccolo; M. Re; F. Zambelli; G. Pesole, The LIBI Grid Platform for Bioinformatics, in: Handbook of Research on Computational Grid Technologies for Life Sciences, Biomedicine and Healthcare, PISCATAWAY, IGI global, 2009, pp. 557 - 613 [capitolo di libro]

P. Di Lena; L. Margara, Undecidable properties of limit set dynamics of cellular automata, in: Proceedings of the 26th International Symposium on Theoretical Aspects of Computer Science, FREIBURG, Susanne Albers, Jean-Yves Marion, 2009, pp. 337 - 348 (atti di: 26th International Symposium on Theoretical Aspec- ts of Computer Science (STACS 2009), Freiburg, Germany, February 26-28 2009) [Contributo in Atti di convegno]

Di Lena P.; Margara L.; Vassura M.; Fariselli P.; Casadio R., A new protein representation based on fragment contacts: towards an improvement of contact maps predictions, in: 5th International Meeting on Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics, VIETRI SUL MARE (SA), s.n, 2008, pp. 42 - 42 (atti di: 5th International Meeting on Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics, Vietri sul Mare (SA), 4/10/2008) [atti di convegno-abstract]

P. Di Lena; L. Margara, Computational complexity of dynamical systems: the case of cellular automata, «INFORMATION AND COMPUTATION», 2008, 206, pp. 1104 - 1116 [articolo]

Vassura M.; Margara L.; Di Lena P.; Medri F.; Fariselli P.; Casadio R., FT-COMAR: fault tolerant three-dimensional structure reconstruction from protein contact maps, «BIOINFORMATICS», 2008, 24, pp. 1313 - 1315 [articolo]

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