Progetto di Dottorato:
Applicazioni basate sui microbiomi per la sostenibilità della produzione alimentare e la valorizzazione degli scarti.
a) Principali olobionti scelti come modello di studio: Vitis vinifera e Capra ibex.
b) Tipologie di matrici biologiche trattate (sample collection, preparation, microbial culturing, DNA extraction, amplification, purification and sequencing) sia in relazione al sopra-citato progetto di dottorato che ad altri progetti nazionali ed internazionali:
- campioni fecali di mammifero (ruminanti, equidi, cetacei, uomo)
- campioni fecali e intestinali di pesci (Osteichthyes)
- campioni di tessuto di Anemonia viridis (Cnidaria)
- campioni radicali di diverse specie di piante coltivate e non
- campioni di neve di alta quota
- campioni da suolo agricolo, boschivo, contaminato e da sedimento marino
- colture pure di muffe/lieviti e colture batteriche
- biofilm microbici di diversa origine
- matrici algali di diversa origine
- campioni di acqua marina e da impianti di acquacoltura e agricoli
- ghiandola intestinale di molluschi bivalvi (Chamelea gallina)
c) Inoltre, verrà svolto un periodo di collaborazione con l’Institute for Bioengineering and Biosciences (iBB), Department of Bioengineering (DBE), Instituto Superior Técnico, Università di Lisbona, col fine di indagare la presenza di biosynthetic gene clusters (BGCs) in MAGs (metagenome-assembled genomes) e genomi di microrganismi simbionti di spugne appartenenti all'ordine Dictyoceratida (Demospongiae, Porifera) e facenti parte del batterioplancton marino, con focus sulla potenziale produzione di metaboliti secondari ad interesse biotecnologico/farmaceutico.
