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Elisa Bonanni

Dottoranda

Dipartimento di Farmacia e Biotecnologie

Settore scientifico disciplinare: BIO/10 BIOCHIMICA

Temi di ricerca

Parole chiave: Bioinformatica Oncologia Computazionale Biologia dei Tumori Machine Learning Rischio Oncologico Rilevazione Precoce Analisi Multi-Omiche

Le due principali linee di ricerca includono:

  1. Valutazione del rischio di cancro e dell'età biologica: sviluppo di metodi, algoritmi e analisi per quantificare il rischio multi-cancro basato sull'accumulo di mutazioni del DNA, integrando dati multi-omici e clinici. L'approccio combina sviluppo teorico. analisi basate sui dati, dai dataset pilota a quelli di scala popolazione, utilizzando strumenti quali processi stocastici, modelli a variabili latenti, equazioni differenziali stocastiche e metodi statistici. 
  2. Rilevazione precoce del cancro: progettazione di metodi e pipeline bioinformatiche per identificare segnali precoci di cancro analizzando pattern di frammentazione del DNA, aneuploidia, medicazione e mutazioni del DNA circolante (cfDNA). Questo include lo sviluppo di algoritmi in grado di classificare campioni sani vs. tumorali, gestendo normalizzazioni di batch effect su dati di sequenziamento genomico completo o approcci amplicon-based.

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