Istruzione e Formazione
November 2015- October 2018
Dottorato di ricerca in Biologia Cellulare e Molecolare (XXXI). Università di Bologna
Attività: Tesi sperimentale intitolata: “The heat-shock response of Helicobacter pylori: genomic and molecular characterization of the master repressor HspR”. (Tutors: Prof. Scarlato Vincenzo and Roncarati Davide). Esperienza in crescita di colture batteriche (E.coli, Pseudomonas aeruginosa, Helicobacter pylory);clonaggi molecolari; Primer extension assay;Hydroxil-radical and DNaseI Footprinting assays; Northern Blot; Real-Time PCR; elettroforesi di DNA/RNA; saggio EMSA; espressione e purificazione di proteine ricombinanti; Western blot; ChIP-sequencing; estrazione e purificazione RNA; Co-ImmunoPrecipitazione; esperienza nella manipolazione di radioisotopi (32P).
Laurea Magistrale in Biologia Molecolare e cellulare (110/110 e Lode). Università di Bologna
Attività: Tesi sperimentale intitolata: “Risposta heat-shock in Helicobacter pylori:ridefinizione del regulone del repressore trascrizionale HspR” (Tutor: Prof.Scarlato Vincenzo).
Laurea Triennale in Scienze Biologiche (110/110). Università di Bologna
Attività: Tesi sperimentale intitolata: “Applicazione di pseudo-peptidi in processi fotochimici”. (Tutor: Prof.Tomasini Claudia).
Esperienza lavorativa
Maggio 2020 –Febbraio 2025
Università di Bologna, Dipartimento di Farmacia e Biotecnologie – FaBiT
Assegno di ricerca
(Tutor: Prof. Giovanni Capranico)
Attività: Colture cellular; Proximity-Ligation assay; esperienza con l’utilizzo di microscopio a fluorescenza e confocale. Generazione e analisi funzionale di geni reporter (GFP, EGFP, luciferase).
Aprile 2019 – Marzo 2020
Università di Bologna, Dipartimento di Medicina Specialistica, Diagnostica e Sperimentale– DIMES in collaborazione con Nouscom company s.r.l. (Castel Romano-RO)
Assegno di ricerca
(Tutor: Prof.ssa Campadelli-Fiume)
Actività: Colture cellulari, manipulazione di virus HSV-1 e generazione di virus ricombinanti; infezione virale, resa virale e preparazione di stock di virioni purificati con gradiente di iodixanolo; trasfezione cellulare; saggio Elisa; estrazione e purificazione di RNA.
Gennaio 2019
Professoressa a contratto per il Corso di Biologia Molecolare - 4 modulo 4 - laboratorio eucariotica – CdS Biotecnologie [cod. 16621] (BIO/11).
Attività di Tutor Didattico
- Università di Bologna: Bando contratti di tutorato FarmaBio a.a. 2017/18 - Bologna e Imola, selezione per l'attribuzione di una attività di tutorato relativa all'insegnamento denominato Biologia Molecolare con Laboratorio [cod. 12946]
- Università di Bologna: Bando contratti di tutorato FarmaBio a.a. 2018/19 - Bologna e Imola, selezione per l'attribuzione di una attività di tutorato relativa all'insegnamento denominato Laboratorio di Microbiologia generale modulo 3-Cds Biotecnologie [cod. 13877]
- Università di Bologna: Bando contratti di tutorato FarmaBio a.a. 2021/2022 - Bologna e Imola, selezione per l'attribuzione di una attività di tutorato relativa all'insegnamento denominato Biologia Molecolare modulo 4-laboratorio eucariotica-CdS Biotecnologie [cod. 16621]
- Università di Bologna: Bando contratti di tutorato FarmaBio a.a. 2022/2023 - Bologna e Imola, selezione per l'attribuzione di una attività di tutorato relativa all'insegnamento denominato Biologia Molecolare modulo 4-laboratorio eucariotica-CdS Biotecnologie [cod. 16621]
- Università di Bologna: Bando contratti di tutorato FarmaBio a.a. 2023/2024 - Bologna e Imola, selezione per l'attribuzione di una attività di tutorato relativa all'insegnamento denominato Biologia Molecolare modulo 4-laboratorio eucariotica-CdS Biotecnologie [cod. 16621]
Università di Bologna: Co-supervisore di Tesi di Laurea Magistrale
Pubblicazioni
- Campilongo R., Fung R. K. Y., Little R. H., Grenga L., Trampari E., Pepe S., Chandra G., Stevenson C., Roncarati D. and Malone J.G. (2017). One ligand, two regulators and three binding sites: How KDPG controls primary carbon metabolism in Pseudomonas. PLoS Genet. doi.org/10.1371/journal.pgen.1006839.
- Pepe S., Pinatel E., Fiore E., Puccio S., Peano C., Brignoli T., Vannini A., Danielli A., Scarlato V., and Roncarati D. (2018). The Helicobacter pylori Heat-Shock Repressor HspR: Definition of Its Direct Regulon and Characterization of the Cooperative DNA-Binding Mechanism on Its Own Promoter. Front Microbiol. 9:1887. doi:10.3389/fmicb.2018.01887.
- Vannini A, Petrovic B, Gatta V, Leoni V, Pepe S, Menotti L, Campadelli-Fiume G, Gianni T. (2020). Rescue, Purification, and Characterization of a Recombinant HSV Expressing a Transgenic Protein. Methods Mol Biol. 2060:153-168. doi: 10.1007/978-1-4939-9814-2_8.
- Menotti L, Leoni V, Gatta V, Petrovic B, Vannini A, Pepe S, Gianni T, Campadelli-Fiume G. (2020). oHSV Genome Editing by Means of galK Recombineering. Methods Mol Biol. 2060:131-151. doi: 10.1007/978-1-4939-9814-2_7.
- Pepe S., Scarlato V. * and Roncarati D.*. The Helicobacter Pylori HspR-Modulator CbpA Is a Multifunctional Heat-Shock Protein. (2020). Microorganisms. 8, 251 ; doi:10.3390/microorganisms8020251.
- De Lucia M., Cotugno G., Bignone V., Garzia I., Nocchi L., Langone F., Petrovic B., Sasso E., Pepe S., Froechlich G., Gentile C., Zambrano N. Campadelli-Fiume G., Nicosia A., Scarselli E. and D’Alise A.M. Retargeted and Multi-cytokine-Armed Herpes Virus Is a Potent Cancer Endovaccine for Local and Systemic Anti-tumor treatment. (2020). Molecular Therapy – Oncolytics. doi: 10.1016/j.omto.2020.10.006.
- Pepe S., Duardo R.C., Guerra F., Capranico G. “Non-B DNA structures as a booster of genome instability”. Biochimie. Volume 214, Part A, November 2023, Pages 176-192. doi: 10.1016/j.biochi.2023.07.002.
