Caratterizzazione di comunità microbiche ambientali in relazione all'attività antropica e all'inquinamento, e sfruttamento dell'attività microbica per il biorisanamento (progetti europei: NYMPHE, MAR2PROTECT).
Caratterizzazione delle comunità microbiche del suolo e loro relazione con produttività dei suoli agricoli, in diversi contesti di agricoltura sostenibile e pratiche agricole innovative (progetti europei: TRIBIOME, RUNFASTER4EU).