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91405 - METAGENOMICA

Anno Accademico 2022/2023

                
                        Docente:
                        Marco Candela
                    
                        Crediti formativi:
                        6
                    
                        SSD:
                        CHIM/11
                    
                        Lingua di insegnamento:
                        Italiano
                    
                        Modalità didattica:
                        Convenzionale - Lezioni in presenza
                        
                            Campus:
                            Bologna
                        
                            Corso:
                            Laurea Magistrale in
                            Biodiversità ed evoluzione (cod. 5824)

                            Risorse didattiche su Virtuale
                        
                                    Orario delle lezioni
                                
dal 17/10/2022 al 20/01/2023

Conoscenze e abilità da conseguire

Gli obiettivi formativi del corso di metagenomica saranno declinati in tre ambiti specifici che coinvolgono aspetti di natura tecnica, biologica e pratica. Saranno quindi trattati i principali aspetti tecnici di uno studio di metagenomica, partendo da disegno sperimentale, approcci di campionamento, preparazione delle libraries e il sequenziamento, fino ad arrivare alle basi di bioinfomatca e biostatistica. Terminati gli aspetti di natura tecnica, si discuteranno applicazioni di metagenomica in diversi ambiti, verranno quindi discusse le traiettorie co-evolutive microbiota-ospite e le implicazioni in termini di medicina personalizzata. Inoltre verranno trattate pionieristiche applicazioni della metagenomica nel contesto “one health”, dove i microbiomi divengono centrali per la salute del pianeta e per la sua storia evolutiva dei suoi abitanti. Durante le esercitazioni gli studenti impareranno a condurre uno studio di metagenomica, partendo dalle sequenze grezze fino alla discussione del dato.

Contenuti

Metagenomica applicata alla “microbiome science”,
Approcci di next generation sequencing
Bioinformatica e biostatistica applicata allo studio dei metagenomi
Ecologia e dinamiche dominanti nelle comunità microbiche
Microbiota e “one helath”, centralità dei microbioti per la vita sul pianeta, interazioni con le dinamiche di “climate change”
Il microbiota intestinale umano, storia co-evolutiva e applicazioni in medicina personalizzata
Il microbiota in olobionti (animali e piante) dalla plasticità fenotipica alla filosimbiosi
Paleometagenomica, studio dei microboti antichi e delle loro dinamiche evolutive e co-evolutive