96047 - CRYSTALLOGRAPHY AND CRYO-ELECTRON MICROSCOPY FOR PROTEIN STRUCTURE DETERMINATION

Anno Accademico 2022/2023

  • Docente: Simona Fermani
  • Crediti formativi: 3
  • SSD: CHIM/03
  • Lingua di insegnamento: Inglese
  • Modalità didattica: Convenzionale - Lezioni in presenza
  • Campus: Bologna
  • Corso: Laurea Magistrale in Molecular and Cell Biology (cod. 5825)

Conoscenze e abilità da conseguire

Al termine del modulo, lo studente ha acquisito i principi basilari per determinare a livello atomico, la struttura di macromolecole biologiche mediante le più attuali tecniche strutturali quali la cristallografia di raggi X e la microscopia elettronica in condizioni criogeniche. Lo studente saprà valutare criticamente l’opportunità di utilizzo di queste tecniche ed interpretare in maniera critica i risultati di un'indagine strutturale di macromolecole biologiche mediante cristallografia e microscopia elettronica.

Contenuti

  • Organizzazione del corso ed introduzione alla biocristallografia;
  • Cristallizzazione di macromolecole biologiche: principi basilari della cristallizzazione, proprietà dei cristalli di macromolecole biologiche e principali tecniche per la cristallizzazione di macromolecole biologiche;
  • Simmetria dei cristalli di macromolecole biologiche;
  • Diffrazione di raggi X: principi fisici e legge di Bragg;
  • Sorgenti di raggi X: generatori tradizionali e sincrotrone;
  • Problema della fase in cristallografia e metodi di risoluzione strutturale di proteine;
  • Validazione della struttura cristallografica e deposito nella banca dati Protein Data Bank.
  • Esempi di strutture cristalline di proteine;
  • Principi base della microscopia elettronica (EM);
  • Confronto tra cristallografia a raggi X e crio-EM nella determinazione di strutture di macromolecole biologiche;
  • Microscopio elettronico;
  • Preparazione del campione e raccolta dati;
  • Analisi delle immagini e risoluzione strutturale;
  • Esempi di strutture crio-EM di macromolecole biologiche.

Testi/Bibliografia

Le diapositive delle lezioni ed il materiale didattico, sarà reso disponibile nella piattaforma Virtuale

Metodi didattici

Le lezioni sono frontali.

Modalità di verifica e valutazione dell'apprendimento

La verifica dell'apprendimento avviene attraverso una prova orale sugli argomenti del corso

Strumenti a supporto della didattica

Videoproiettore, PC. Tutte diapositive mostrate a lezione ed eventuali materiali aggiuntivi saranno resi disponibili in formato elettronico.

Orario di ricevimento

Consulta il sito web di Simona Fermani