93985 - INNOVATIVE APPROACH FOR RISK ASSESSMENT IN MICROBIOME FOOD VALUE CHAIN

Anno Accademico 2022/2023

  • Docente: Marco Candela
  • Crediti formativi: 3
  • SSD: CHIM/11
  • Lingua di insegnamento: Inglese
  • Modalità didattica: Convenzionale - Lezioni in presenza
  • Campus: Bologna
  • Corso: Laurea Magistrale in Food Safety and Food Risk Management (cod. 9140)

Contenuti

Lo studente imparerà: (i) obiettivi principali di uno studio di metagenomica; (ii) tecniche e tecnologie per lo studio dei metagenomi; (iii) ruolo dei microbioti nei sistemi alimentari e nella produzione di cibo, con particolare riferimento alla valutazione del rischio.

Contenuti

  1. Introduzione generale allo studio dei metagenomi: metagenomica, ecosistemi microbici e microbiomi definizione, importanza e applicazioni; aspetti tecnici e goals di uno studio di metagenomica, tipologie di studi di metagenomca, tecniche di sequenziamento di nuova generazione (NGS).
  2. NGS sequencing: campionamento, estrazione di DNA, preparazione delle libraries di sequenziamento e multiplexing; approcci di marker gene e shotgun metagenome.
  3. Principi di analisi bioinformatica:demultiplexing, filtraggio e mappaggio delle sequenze, ricostruzione dei contigues, assegnazione su database di riferimento, statistica multivariata
  4. Microbioti nei sistemi alimentari: microbioti negli attori di filiera e significato per la sicurezza, produttività e qualità dei sistemi alimentari, microbioti e valutazione del rischio nella produzione di alimenti.

 

Testi/Bibliografia

Lesk Introduction to Bioinformatics (V Edition_2019)

Metagenomics, perspectives, methods and applications, M Nagarajan (2017)

Brook, biology of microorganisms 15th edition

Appunti e pubblicazioni scientifiche

Metodi didattici

Lezioni orali e seminari

Modalità di verifica e valutazione dell'apprendimento

Esame orale

Strumenti a supporto della didattica

Computers

Orario di ricevimento

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SDGs

Consumo e produzione responsabili

L'insegnamento contribuisce al perseguimento degli Obiettivi di Sviluppo Sostenibile dell'Agenda 2030 dell'ONU.